Třetím z koloběhů taktéž důležitých životních látek po koloběhu vody, uhlíku a kyslíků je koloběh fosforu a dusíku v přírodě. Aneb přeměna a následná asimilace.
Fosfor a dusík jsou základními složkami živé hmoty. Nejsou živými organismy přijímány přímo, ale je jich na Zemi velké množství.
Koloběh fosforu
V čistém stavu fosfor v atmosféře nenajdeme. V mateřské hornině najdeme fosfor vázaný ve formě fosfátů. Erozí se fosfáty uvlňují do půdy a tam mohou být rostlinami vstřebávány. Rostliny v kombinaci fosforu a jiných látek vytvářejí živou hmotu, tak se potravním řetězcem přenáší na býložravce a dále na masožravce. Zpět do půdy vracejí fosfor mikroorganismy, které rozkládají odumřelé organismy a exkrementy. Poté se cyklus opakuje.
Fosfáty zůstávají někdy v atmosféře ve formě suspenze do doby, než je vrátí na zemský povrch srážky. Fosfor je důležitým prvkem pro živé organismy, tvoří součást jejich DNA, tedy základní složky chromozomů. V oceánech fosfáty sedimentují a tvoří část usazenin oceánského dna, které za několik milionů let mohou geologické pohyby vynést zpět na zemský povrch.
Koloběh dusíku
Plynný dusík značící se N2 je v zemské atmosféře hojně zastoupeným prvkem, ale nemůže být asimilován živými organismy přímo. Musí být totiž nejdříve vázán v minerální formě a to kombinací s jinými prvky. Dochází k tomu v atmosféře například vlivem slunečního záření nebo během hoření či působením blesků. Dusík vážou velmi často půdní organismy a ty vytvářejí amonné a dusičnaté ionty. Tento vázaný dusík již rostliny přijímají a využívají ho na tvorbu aminokyselin. Přenáší se tak do jejich těl. Některé mikroorganismy přeměňují denitrifikační reakcí organický dusík zpět a to až na dusík plynný.
> Některé mikroskopické řady, např. modrozelené řady, vážou dusík potřebný pro vodní faunu.
> Bakterie rodu Pseudomonas běžně se vyskytující v půdě a ve sladké vodě rozkládají dusičnany a vracejí do atmosféry dusík.
> Bakterie rodu Rhizobium žijí v uzlících či malých bobulích pohromadě a jsou přichycené ke kořenům některých luštěnin. poskytují rostlinám dusík a obohacují tím půdu.
> Anaerobní bakterie rodu Clostricidium vážou v půdě dusík.
Použití: Počasí, cesty za poznáním